Jan Peterek se narodil v roce 1971 v Havířově, kde také udělal první hokejové krůčky. Svoji extraligovou kariéru zahájil v roce 1991 v týmu Vítkovic. Po čtyřech letech se přesunul do Třince, kde v sezoně 1997/98 byl s týmem ve finále extraligy. Přes havířovské Pantery a finský Ässät Pori zamířil hráč s jedenáctkou na drese na tři roky do ruské Jaroslavli, kde hned v prvních dvou sezonách získal ruský titul.
Do české nejvyšší soutěže se vrátil v sezoně 2004/05. Hned v zahajovacím utkání ročníku, ve kterém díky výluce NHL působilo množství hvězdných hráčů, nasázel Tomáši Vokounovi v brance Znojma čtyři branky a vryl se hluboko do srdcí všech fanoušků Ocelářů.
Měl značný podíl na zisku premiérové mistrovské trofeje Ocelářů v dubnu 2011. Stal se nesmazatelně velkou postavou historie třineckého hokeje, za Oceláře celkem odehrál 675 extraligových zápasů, ve kterých zaznamenal 157 gólů a 295 asistencí. Zdobila jej tvořivost a vysoká herní inteligence. Díky své přirozené autoritě několik sezon zastával funkci kapitána. Jeho dres s číslem 11 byl v listopadu 2019 slavnostně vytažen pod strop WERK ARENY.
Po ukončení aktivní kariéry (2014) pracoval u Ocelářů na pozici manažera mládeže. Významnou měrou se podílel na vzniku projektu partnerského klubu Ocelářů ve Frýdku-Místku. V prosinci 2016 byl jmenován do funkce sportovního ředitele. Jan Peterek je ženatý, s manželkou Ladou má syny Daniela a Jonáše.